В дополнение к седации, колоноскопия СО² является вторым важным компонентом «щадящей колоноскопии». Вместо воздуха используется углекислый газ (СО²) для наполнения кишечника. Углекислый газ выходит из кишечника в 150 раз быстрее, чем воздух, поэтому обычно после наполнения не возникает ощущение вздутия живота, а осмотр проходит гораздо приятнее.