Эндосонография является внутренним ультразвуковым обследованием. Ультразвуковой датчик контактирует со слизистой оболочкой прямой кишки, таким образом можно обследовать стенки кишечника, непосредственную среду, а также мышечные части сфинктера и мышцы тазового дна.